Non esiste un amplificatore totalmente trasparente. Sia il finale Kemper che il finale della CLR che il finale RS hanno un proprio carattere.
In generale, si può ritenere che il finale integrato in una cassa attiva faccia suonare la cassa in maniera "ideale" (con l'accortezza che questa idealità è sempre decisa dai progettisti sulla base del budget e del target). Ma un amplificatore eccellente suonerà comunque bene in una vasta gamma di applicazioni.
Non devi poi pensare che la classe di funzionamento di un amplificatore ne determini il suono: esistono amplificatori a valvole estremamente lineari e musicali. I valvolari per chitarra sono progettati in modo da distorcere.
In generale sì, una cassa attiva e una passiva - se usano due finali diversi - suonano diversamente. La questione è poi se l'ascoltatore è in grado di percepire queste differenze, anche in dipendenza dall'uso che farà del sistema.